Paralelní výpočetní systémy

Salomon

Klastr SGI, IT4I, Ostrava.

Klastr se skládá z 1008 výpočetních uzlů, celkově s 24192 výpočetními jádry a 129 TB operační paměti, které dávají přes 2 Pflop/s teoretického špičkového výkonu:

  • Výpočetní uzly:
    • 576x bez akcelerátoru, 2x 12-jádrový procesor Intel Xeon E5-2680 v3 (2.5 GHz), paměť 128 GB, bez lokálního disku.
    • 432x s MIC akcelerátorem, 2x 12-jádrový procesor Intel Xeon E5-2680 v3 (2.5 GHz), paměť 128 GB, bez lokálního disku, 2x MIC akcelerátor Intel Xeon Phi 7120P (61 jader, paměť 16 GB).
    • 2x s GPU akcelerátorem (pro vizualizační účely), 2x 14-jádrový procesor Intel Xeon E5-2695 v3 (2.3 GHz), paměť 512 GB, bez lokálního disku, GPU akcelerátor Nvidia Quadro K5000 (paměť 4 GB).
    • 2x SMP/NUMA systém SGI UV 2000 (pro paměťově náročné výpočty), 14x 8-jádrový procesor Intel Xeon E5-4627 v2 (3.3 GHz), paměť 3328 GB, 2x lokální disk SSD 400 GB.
  • Propojení:
    • InfiniBand FDR56, 7D enhanced hypercube.
    • Gigabit Ethernet.
  • Software: operační systém CentOS Linux 6.6 (klon Red Hat), PBS Pro 12 pro správu distribuovaných výpočetních zdrojů a další.

Anselm

Klastr Bull, IT4I, Ostrava.

Klastr se skládá z 209 výpočetních uzlů, celkově s 3344 výpočetními jádry a 15 TB operační paměti, které dávají přes 94 Tflop/s teoretického špičkového výkonu:

  • Výpočetní uzly:
    • 180x Bullx B510 blade server bez akcelerátoru, 2x osmijádrový procesor Intel Sandy Bridge E5-2665 (2.4 GHz), paměť 64 GB, lokální disk SATA III 500 GB.
    • 23x Bullx B515 blade server s GPU akcelerátorem, 2x osmijádrový procesor Intel Sandy Bridge E5-2470 (2.3 GHz), paměť 96 GB, lokální disk SATA III 500 GB, GPU akcelerátor Nvidia Tesla Kepler K20.
    • 4x Bullx B515 blade server s MIC akcelerátorem, 2x osmijádrový procesor Intel Sandy Bridge E5-2470 (2.3 GHz), paměť 96 GB, lokální disk SATA III 500 GB, MIC akcelerátor Intel Phi 5110P.
    • 2x Bullx R423-E3 server (FAT uzel), 2x osmijádrový procesor Intel Sandy Bridge E5-2665 (2.4 GHz), paměť 512 GB, 2x lokální disk SATA III 300 GB a 2x lokální disk SSD 100 GB.
  • Propojení:
    • širokopásmová síť InfiniBand QDR (IB 4x QDR, 40 Gbps) s nízkou latencí, plně neblokující stromová (fat-tree) síťová topologie, přenosová rychlost 2170 MB/s skrz TCP spojení (single stream) a až 3600 MB/s skrz nativní Infiniband protokol.
    • Gigabit Ethernet, přenosová rychlost 114 MB/s.
  • Sdílený diskový systém:
    • HOME Lustre object storage, 1x diskové pole NetApp E5400, 227x disk NL-SAS 2 TB v RAID6.
    • SCRATCH Lustre object storage, 2x diskové pole NetApp E5400, 106x disk NL-SAS 2 TB vn RAID6.
    • Lustre metadata storage, 1x disk array NetApp E2600, 12x disk SAS 300 GB v RAID5.
  • Software: operační systém Bullx Linux Server 6.3 (klon Red Hat), PBS Pro 12 pro správu distribuovaných výpočetních zdrojů, kompilátory Intel Parallel Studio 13.1 a GNU, MPI (Bullx 1.2.4, Intel 4.1, OpenMPI 1.6 a 1.8, MPICH2 1.9), programové nástroje pro numerické výpočty PETSc 3.4.4, Trilinos 11.2.3, ANSYS, COMSOL Multiphysics a další.

Enna

Symetrický multiprocesor Supermicro, Ústav geoniky AV ČR, Ostrava:

  • Hardware: barebone systém Supermicro SuperServer 5086B-TRF, 8x osmijádrový procesor Intel Xeon E7-8837 (2.66 GHz, 32nm, smart cache 24 MB), sdílená paměť 512 GB, diskový subsystém s 2x pevným diskem SATA III 2 TB (sw RAID-1) a 1x diskem SSD SATA III 256 GB pro operační systém, grafický akcelerátor Asus GTX650-DC-1GD5 (384 CUDA cores), karta IPMI.
  • Software: operační systém CentOS 6.3, vývojová prostředí Intel Cluster Studio XE 2013 for Linux a CUDA 5.0, programové nástroje pro numerické výpočty Matlab 2011b (včetně Parallel Computing Toolbox 5.2), Comsol Multiphysics 4.4 (s moduly Structural Mechanics, Subsurface Flow a LiveLink for MATLAB) a další.

Hubert

Symetrický multiprocesor TYAN, Ústav geoniky AV ČR, Ostrava:

  • Hardware: barebone systém Tyan Transport VX50-B104985, 8x čtyřjádrový procesor AMD Opteron 8380 (2.5 GHz, L2 cache 4x 512 kB, L3 cache 6 MB), sdílená paměť 128 GB, diskový subsystém s 8x pevným diskem SAS 450 GB, grafický akcelerátor Nvidia GeForce GTX 280, numerický akcelerátor Nvidia Tesla C1060 (na bázi GPU), karta IPMI, zdroj nepřetržitého napájení (UPS) APC Smart-UPS 3000 VA.
  • Software: operační systém CentOS 6.0, vývojová prostředí Intel Cluster Studio XE 2013 for Linux a CUDA 4.1, programové nástroje pro numerické výpočty Matlab 2011, Comsol 4.2, Ansys 13.0, Elmer, Trilinos a další.

Archiv:  Ra  Simba  Termit  Thea  Natan  Lomond